In der Johannischen Kirche liegt die Leitung nicht mehr in den Händen von Nachfahren des Gründers Joseph Weißenberg. Am 30.12. 2019 war die langjährige bisherige Leiterin und Enkelin von Joseph Weißenberg, Josephine Müller, im Alter von 70 Jahren in Berlin-Wannsee verstorben. 

Bereits im November hatte Josephine Müller Stefan Tzschentke zu ihrem Nachfolger berufen. Am 13. Dezember 2019 hat er die Leitung übernommen und am 11. Januar 2020 Daniel Stolpe zu seinem Stellvertreter und Nachfolger eingesetzt.  Beide Personen gehörten bereits dem Vorstand der Gemeinschaft an und wahren hauptamtlich in der Kirchenadministration beschäftigt.